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科學家找到預測基因表達的新方法

胚胎發育過程就像一個組織良好的建築項目,而胚胎中DNA則是該項目的圖紙,根據圖紙控制基因的不同組合,並進行表達實現細胞不同的功能。在基因表達過程中,轉錄因子通過與順式調控元件(cis-regulatory modules ,CRMs)結合,調控基因表達的開啟和關閉。

  最近,歐洲分子生物學實驗室(EMBL)的研究人員發現,精確的預測不同的CRMs被激活的時間和位置或許成為可能。這篇研究報告發表在《Nature》雜誌上。

  研究人員通過全面的、系統的研究方法發現,有大約8000個CRMs參與調節果蠅(Drosophila)肌肉發育過程,EMBL研究人員還對轉錄因子和CRMs結合模式進行記錄,根據肌肉的類型以及發育階段對這些被激活的CRMs進行分組,通過計算機將具有相似激活模式的CRMs分到一組,CRMs相同的激活模式或許意味著這些CRMs參與調節同種肌肉的發育過程。

  研究人員對這種實驗預測方法進行測試,發現結果不但非常精確,而且很有啟發性。轉錄因子與CRMs之間結合模式不同或許有相似的激活模式。因此,這種不同的轉錄因子組合可以調節相同的發育過程的事實也說明,果蠅進化過程中,即使某些轉錄因子或CRMs發生改變或缺失,也不會阻礙發育過程的進行。
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